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细菌都有一定的大小，如果过滤器的滤膜，或者滤柱，（或者其他的），孔径小于细菌的直径，那么当液体或者气体通过的时候，细菌就被挡住，过不去，那么过去的液体或者气体，就是无菌的。

一般小于0.22微米的孔，应该就可以滤菌了。然而病毒因为其结构微小，数量级为纳米，所以可以通过细菌过滤器 。